不管是哪种窖型，都要有良好的通气设备，较好的保温防寒功能，还要结构坚固耐用，管理方便。紫薯窖址要选在背风向阳、地势高燥、地下水位低、土质坚实和管理、运输方便的地方建窖。紫薯入窖前，将紫薯新窖打扫干净，旧窖消毒灭菌。消毒方法是，可将窖壁及窖底刮去3-4厘米，以除掉附在窖壁上的各种病菌，并在紫薯窖底撒一层生石灰；也可用硫磺熏窖，一般每立方米空间用硫磺10克，点燃后封闭1-2天，之后放出烟气。消毒灭菌后，将窖底铺上6-10厘米厚干净细沙，上面再铺放5厘米厚的秸秆或柴草，紧挨窖壁再竖向摆放5-7厘米厚的秸秆，以防湿保温。